况且，明熹宗是他一手带大，爷俩感情之深，俨若父子。所以，他才会哭得二目皆肿，神昏意迷，连坏念头也暂时停转。
不仅老魏悲伤欲绝，熹宗皇帝奶妈客氏也哭得死去活来，她在灵前跪哭，从小金盒子里面拿出黄绫包裹的熹宗儿时“胎发痘痂”以及累年积存的剃发、落齿、指甲等物，边哭边烧，几近昏厥。
这两位大恶之人此时的悲痛，全无一丝做戏成分。一是因为多年的亲情，二是因为他们内心中产生的那种黑色不祥的预感：作为“寄主”的皇帝死了，他们这些“虫子”再大再硬朗，还能支持几天？
信王朱由检即皇帝位，是为明朝最后一位皇帝，即明思宗崇祯皇帝。
为试探新帝的意思，魏忠贤上表乞辞官职。新帝老成谨慎之人，佯装不许，先稳住魏公公。但是，“奉圣夫人”客氏已经没有在宫中呆下去的理由，她灰溜溜搬出皇宫。
崇祯皇帝继位时仅十七岁，处事非常冷静、机敏。登基后，他不仅没动魏忠贤，还很快颁旨，授魏忠贤的侄子和侄孙以“铁券”，似乎是给老魏家上保险一样。外臣不知就里，江西巡抚杨邦宪等人仍旧上疏申请为魏忠贤建生祠，诏报不许。这，似乎是魏忠贤要倒霉的信号。
隔了几天，登莱巡抚上奏宣川大捷，行功论赏，魏忠贤、崔呈秀等人皆有份儿。这一切，均使观望的众臣摸不住头脑，阉党心里也拿捏不准新皇的意图。
原本是魏阉党羽的御史杨维垣由于阉党首领之一魏广微不提拔重用他，心怀怨恨。嗅闻政治空气后，他与表叔徐大化详商后，决定先行参劾崔呈秀，准备以之押宝。如此，阉党倒台，他就会成为首批倒阉党的“功臣”。世事确实可笑，天启帝死后，第一个跳出来与阉党对着干的人，竟然是最早替魏忠贤把忠臣顾大章牵入熊廷弼案中的阉党骨干分子。
崇祯帝随波就势，按奏章办事，先罢崔呈秀之官。不久，下诏给予首先上奏为魏忠贤建生祠的浙江巡抚潘汝桢以削籍处分。
接着，工部主事陆澄源上疏，指出魏忠贤所受恩爵过厚，但未敢显斥。紧跟而至的兵部主事钱元悫不客气，上劾魏忠贤不法。钱主事文章写得好，文学气十足，铺陈恣肆，只是没说到点子上。正在这时，又有浙江贡生钱嘉征上书，详详细细列明魏忠贤十大罪恶：
曰“并帝”：封章必先关白，至颂功德，上配先帝；及奉谕旨，必云“朕与厂臣”，从来有此奏体乎？曰“蔑后”：皇亲张国纪未罹“不赦”之条，先帝令忠贤宣皇后灭旨不传，致皇后御前面折逆奸；遂罗织皇亲，欲致之死。赖先帝神明，祇膺薄愆。不然，中宫几危！曰“弄兵”：祖宗朝不闻内操，忠贤外胁臣工、内偪宫闱，操刀厉刃，炮石雷击。曰“无二祖列宗”：高皇帝垂训“中涓不许干预朝政”，乃忠贤一手障天，仗马辄斥，虿毒搢绅，蔓连士类；凡钱榖衙门、边腹重地、漕运咽喉，多置腹心，意欲何为？曰“克剥藩封”：三王之国，庄田赐赉不及福藩之一；而忠贤封公侯伯之土田，拣选膏腴，不下万顷。曰“无圣”：先师为万世名教主，忠贤何人，敢祠太学之侧！曰“滥爵”：古制非军功不侯，忠贤竭天下之物力佐成三殿，居然袭尚公之爵，腼不知省！曰“邀边功”：建贼（满洲人）犯顺以来，堕名城、歼士女、杀大帅，神人共愤；今未恢复尺寸地、广宁稍捷，袁崇焕功未克终、席未及暖，忠贤冒封侯伯。假辽阳、广宁复归版籍，又何以酬之乎？曰“朘民脂膏”：郡县请词不下百余，计祠费不下五万金；敲骨剥髓，孰非国家之膏血！曰“通同关节”：顺天乡榜二十六日拆卷，而二十四日崔铎贴出，复上忠贤书；其夤缘要结，不可胜数。
魏忠贤得知几个人弹劾他的消息，并不知详情，急赤白眼跑入宫中，跪哭自诉于崇祯皇帝。
见昔日威风八面的魏公公如此样，崇祯帝心内暗笑，就让他的同党太监王体乾大声朗读钱嘉征奏疏。
魏忠贤跪听，惶骇至极，汗下如雨。
面如死灰的魏忠贤出宫回家，绞尽脑汗，想起崇祯帝当王爷时有个宠信太监徐应元是自己昔年乡间的老赌友，便攀住这根“救命稻草”，连夜送无数珍宝于徐公公，表示自己要把东厂太监的职位让与老徐，让他在皇上面前为自己说几句好话。
崇祯帝不是天启帝，立刻叱责徐应元受贿为魏忠贤进言，下诏把他谪戍于远地。这样一来，魏公公只有在家中等宰的份儿。
到了十一月，崇祯帝下诏免去魏忠贤东厂太监等要职。由于害怕他的亲戚党羽急红眼生变，对那些人仅采取降职处理，剥夺手中握兵的实权，没有立刻下狠手诛除。
呆了数日，见魏党根本没有任何反弹迹象，崇祯帝胆气上来，下诏贬魏忠贤凤阳安置，将客氏交浣衣局收押，同时对他们进行抄家。对于魏忠贤与客氏的罪恶名，一一列出：
朕闻去恶务尽，御世之大权，人臣无将，有位之炯戒。我国家明悬三尺，严惩大憝，典至重也。朕览诸臣屡列逆恶魏忠贤罪状，俱已洞悉。窃思先帝以左右微劳，稍假恩宠，（魏）忠贤不思尽忠报国，以酬恩遇，乃逞私植党怙恶肆奸，擅作威福，难以枚举。略数其概：将皇兄怀宁公主生母成妃李氏，假旨革夺，至今含冤未雪；威逼裕妃张氏，立致弃生；借旨将敢谏忠直之臣，罗列削夺，又同心腹酷刑严栲，诬捍赃私，立毙多命。他若謇谔痛于杖下，柔良苦于立枷。臣民重足，道路以目。而身受三爵，位崇五等，极人臣未有之荣。通同客氏，表里为奸，先帝弥留之时，犹叼恩晋秩，亡有纪极。赖祖宗在天之灵，天厌巨恶，神夺其魄，罪状毕露。朕思忠贤等不止窥攘名器，紊乱刑章，将我祖宗蓄积贮库传国奇珍异宝金银等朋比侵盗几空，本当寸磔，念梓宫在殡，姑置凤阳。二犯家产，籍入官。其冒滥宗戚，俱烟瘴永戍。
从前的“九千九百岁”，现在连一条狗都不如！魏忠贤只得乖乖上路。走了三天，一行人晚间在阜城一家尤姓店主家所开小旅舍歇脚，魏公公接到京中党徒的密报：朝廷新下诏旨，要逮捕他回京重新收审。
大公公昔日虐畜一样杀人无数，想到自己很快要回到锦衣卫诏狱中的那个活地狱，亲身感受昔日他以为笑乐的残酷刑罚，老魏浑身上下连指甲盖都冰凉。绝望之下，思前想后，明白脱不开一个“死”字。
于是，延至半夜，泪眼模糊，魏公公与他的同党宦官双双对缢于房梁。
作恶多端的魏忠贤，竟得“良死”。
客氏方面，锦衣卫抄家时搜出八个怀孕的年轻妇女，据称可能是想趁明熹宗临崩前混入宫冒充“皇子”之用。
崇祯帝大怒，马上命令卫士赴浣衣局，大棒交下，把老娘们打成一堆肉泥。
崔呈秀当时在苏州家中被拘押待勘。得知魏忠贤败讯，他自知不免。于是，一夜之间，他大开筵宴，令数十妓妾白肉相陈陪酒，遍摆几年来收受的奇珍奇宝，开启数坛美味御酒，敞怀畅饮。每满饮一杯，他均捡起一件宝物，熟视后猛摔于地毁碎。一连畅饮十杯，摔碎无数价值连城的珍稀之宝。大笑之余，复又痛哭。崔呈秀的众多姬妾皆心中茫然，不知主人为何得了失心痛。
大醉酩酊之下，这位阉党主谋往房梁上甩了一根白绳，悬梁自尽。
至于魏忠贤族人，如其侄魏良卿等人，凡是姓魏的有亲戚关系的，一个不剩，皆押入闹市问斩。数百颗大小男女人头，放满了几箩筐。其中有不少还是婴儿，小身子摆在大刀之下时，还静静在睡梦之中。“天下以为惨毒之报，无不快之。”
杀掉这头一批“首恶”后，崇祯帝召回从前被阉学排挤的首辅韩旷，要他组织人力清查魏忠贤党羽。韩阁老厚道人，对老仇人们网开一面，细查慢究，数日也没有上报人名数字。
崇祯帝这时沉不住气，力催吏部、刑部官员协查办案，终于在崇祯二年公布“逆案”名单，颁示天下：
首逆凌迟者二人：魏忠贤，客氏（魏忠贤已死，只能戮尸）。
首逆同谋决不待时者六人：（崔）呈秀及魏良卿，客氏子都督侯国兴，太监李永贞、李朝钦、刘若愚。
交结近侍秋后处决者十九人：刘志选、梁梦环、倪文焕、田吉、刘诏、薛贞、吴淳夫、李夔龙、曹钦程，大理寺正许志吉，顺天府通判孙如冽，国子监生陆万龄，丰城侯李承祚，都督田尔耕、许显纯、崔应元、杨寰、孙云鹤、张体乾。
结交近侍次等充军者十一人：魏广微、周应秋、阎鸣泰、霍维华、徐大化、潘汝祯、李鲁生、杨维垣、张讷，都督郭钦，孝陵卫指挥李之才。
交结近侍又次等论徒三年输赎为民者：大学士顾秉谦、冯铨、张瑞图、来宗道，尚书王绍徽、郭允厚、张我续、曹尔祯、孟绍虞、冯嘉会、李春晔、邵辅忠、吕纯如、徐兆魁、薛风翔、孙杰、杨梦衮、李养德、刘廷元、曹思诚，南京尚书范济世、张朴，总督尚书黄运泰、郭尚友、李从心，巡抚尚书李精白等一百二十九人。
交结近侍减等革职闲住者，黄立极等四十四人。
魏忠贤亲属（可能是姻亲疏属）及内官党附者又五十余人。
名单中应该注意的是，首先弹劾阉党的原阉党杨维坦也被惩治，受到削籍处理，罪名是“逆阉亲信，占气最先，转身最捷，贪无为功，沽名反复”。小人枉为小人。此外，名单中还有最早与阉党分手的兵部尚书霍维华。