所以，崇祯帝自缢煤山的悲剧，其实早在明朝建立的那一刻已经有了某种征兆。帝国初立，已经有疲惫之态。
再接再励定国家——方国珍降、陈友定灭、两广归附、蜀地纳款、云南大定
甫灭张士诚，朱元璋迫不及待下令对方国珍动手。
方国珍是元末群雄中辈分最高的“革命”老前辈。诸多人中，属他起事最早，元顺帝至正八年（1348年）,他就聚众千人劫掠元朝运粮船，梗塞海道。
此人长相也奇特，史载，他“长身黑面，体白如瓠”，仔细思之，也不奇，脸黑，是因为他“世以贩盐浮海为业”，太阳晒的；身体皮肤白，衣服拦住阳光，所以就白。
无论如何，方国珍四兄弟横行海上，忽东忽西，让元朝伤透了脑筋。后来，对元朝他也是忽降忽叛，据有温州、台州等地，并受元朝诏命进攻张士诚，且七战七捷。不久，张士诚受招安，也当上了元朝的“太尉”，二人才停止相攻。
方国珍初作乱时，元朝很当回事，官府出空白宣赦数十道，募人击贼，海滨壮士多应募，打得方国珍有些架不住。但元地方政府官吏腐败，该赏官时反而向击贼者索重贿，对方只要不出钱，根本也得不到官，往往有一家数人战死而最终不得官者。反观方国珍党徒，元朝一再招安抚谕，子弟宗族皆至大官，由此当地人羡慕他们，转而加入其中为盗，方国珍手下日益众多。
虽然起事早，方国珍并无大志。朱元璋攻取婺州后，他忙奉书送黄金五十斤、白银五十斤以文绮白匹来献，并派次子方关为人质向老朱“效忠”。
朱元璋也会做，归还其质子，厚赐遣返，并派人委任方国珍为“福建行省平章事”。
方国珍阴持两端，一面受朱元璋印诰，一面仍派海船替张士诚运粮输往元朝大都。
朱元璋军队攻克张士诚杭州后，方国珍大恐，一面遣使佯称贡献侦察形势，一面暗中勾结王保保和陈友定等人，阴图互为犄角。
朱元璋闻讯大怒，移书数其罪，并责军粮二十万石让他来献。
方国珍倒不是特别慌，海贼出身的他，日夜倒腾珍宝，大治舟楫，时刻准备逃往海上。
张士诚被灭后，朱元璋大军来势汹汹，台州、温州皆被攻克。方国珍自知不敌，率所部乘船遁入海中。但是，朱元璋手下也有“水贼”出身的将领廖永忠等人，率水军配合汤和等人的陆军倾力围剿，方国珍部下多降。
本来老朱十分恼怒这个三心二意的东西，但方国珍手下詹鼎写的“谢罪表”写得好，朱元璋览后顿起可怜之意：
“臣闻天无所不覆，地无所不载。王者体天法地，于人无所不容。臣荷主上覆载之德久矣，不敢自绝于天地，故一陈愚衷。臣本庸才，遭时多故，起身海岛，非有父兄相藉之力，又非有帝制自为之心。方主上霆击电掣，至于婺州，臣愚即遣子入侍，固已知主上有今日矣，将以依日月之末光，望雨露之余润（拍老朱马屁，说自己早知道老朱是真天子）。而主上推诚布公，俾守乡郡，如故吴越事。臣遵奉条约，不敢妄生节目。子姓不戒，潜构衅端，猥劳问罪之师，私心战兢，用是俾守者出迎（从前的冒犯，我部知情，都是属下们干的，我一直孝敬）。然而未免浮海，何也？孝子之于亲，小杖则受，大杖则走，臣之情事适与此类（这几句话最让老朱开心，看见比自己岁数还大的革命老前辈拿自己当亲爹来比拟，能不高兴吗）。即欲面缚待罪阙廷，复恐婴斧钺之诛，使天下后世不知臣得罪之深，将谓主上不能容臣，岂不累天地大德哉。（如果您杀我，可就是您的不厚道了）”
方国珍在信中把老朱比成亲爹，把自己比成犯事避杖逃走的“儿子”，不能不让老朱欣喜。于是，他表示说，方国珍虽然负恩实多，只要投降，我仍饶你一命。
方国珍至建康后，老朱当面责让：“你来得太晚了！”
老方装可怜，顿首谢罪。
老朱心中舒服，授他为“广西行省左丞”，食禄而不之官，赐大宅院于建康，挂个荣衔养起来。
明朝成立后，老方还多次以“功臣”身份参加盛大宴会。一次预宴，他忽发脑溢血，“嗷”的一声就倒地了。
朱元璋对老方特厚道，忙授其二子官职，派人通知濒死的方国珍。老方欣慰颔首，死了。
如此导致元朝灭亡的大祸首，又落在朱元璋手里，竟然善终，真是一个天大的奇迹。
方国珍此人，也有一“花絮”可表。他割据一方时，其女儿年方妙龄，由于病痘，前往延庆寺祈福。庙中一个名叫竺月华的年轻和尚风流轻佻，看见美人来庙内，便顺口吟诵《望江南》词，挑逗方国珍女儿：“江南柳，嫩绿未成阴。枝小未堪攀折取，黄鹂飞上力难禁，留下待春深”，词中很有些猥亵的意思。
方姑娘人小心细，冰雪聪明，回家后就向父亲告状，说和尚调戏自己。
方国珍大怒，命人立刻把“贼秃”捆来，准备装入“猪笼”内扔到水中淹死。
见押来的和尚容貌俊俏，吓得浑身乱颤，方国珍又笑又气，仿效其口吻，也作词一首：“江南竹，巧匠结成笼。好与吾师藏法体，碧波深处伴蛟龙。方知色是空。”老方本来大字不识的一个粗人，此时倒很有幽默。
临死之际，竺月华这个年轻和尚还算镇定，表示说：“死即死耳，容我再作词一首。”方国珍答应。
竺和尚吟道：“江南月，如鉴亦如钩。如鉴不临红粉面，如钩不上画帘头。空自惹肠愁。”
见年轻俏和尚以自己名字入词，“自我批评”自我贬损一番，方国珍转怒为喜，笑言：“这次就放掉这你个小和尚！”
由此事可以见出，方国珍的确不是一般的憨人粗汉。
在发兵攻打方国珍时，1367年冬，朱元璋派中书平章胡廷美为征南将军，会同江西行省左丞何文辉，前去福建平灭陈友定。不久，又令汤和、廖永忠由海道进攻福州。
元朝这位大将陈友定，与陈友谅没有亲戚关系。
陈友定，字安国，福建福清人，小商贩出身，在明溪驿任驿卒。由于善谈兵事，为元朝汀州地方官蔡某赏识，授为黄土寨巡检，以讨山贼起家。元末大乱，英雄莫问出处，陈友定几年内就当了清流县令。至正十九年（1359年），奇qisuu.书陈友谅部将攻汀州，被陈友定击退，元朝政府让他为福建行省参政。
与陈友谅打了三年，福建大部皆归陈友定所有，元朝的福建行省平章政事燕只不花徒拥虚名而已，陈友定才是真正行省的一把手。到了至正二十四年，大都方面诸道隔绝，只有陈友定每年向大都朝廷运输贡物，由于绕取海道，十次运物只有三四次能送到，很有一番忠心赤诚。
至正二十五年，陈友谅受元廷之命，进攻过朱元璋的地盘处州（浙江苏省水），但没得到便宜，匆忙撤军。
陈友定虽拥八闽之地，但各地守将心意不一，多有向朱元璋归降者，诸城相继被攻下，福州也被汤和所攻陷。
陈友定无奈，只得拥兵死守延平（南平）。不久，漳州、泉州、建宁（建瓯）皆落入明军之手。
汤和、廖永忠先礼后兵，攻延平前派出使节去招降陈友定。陈友定杀掉来使，他与诸将歃血为盟，发誓忠于元朝。但陈友定毕竟不是大军事家，总以为明军千里远道而来，诫使诸军毋出战，想待明军气泄兵疲时再出城攻杀。
长期固守愁城，将吏多怨。诸将被围急了，缺衣少吃，想冲出拼死一搏，也为陈友定所阻。在这种情势下，城内将士多有出城投降者，陈友定因疑心，又枉杀一员能战大将，致使众心解体。
受围十日后，延平城内有炮声响。明军误以为是城中降将内应，鼓嗓登城，歪打正着，很快就攻克延平坚城。
陈友定知大事已去，对左右从官讲，“公等善自为计，我为元朝死耳！”他独坐省堂，按剑仰药自杀。
明军来得快，灌水压腹，为陈友定排毒，把活人押送建康。
朱元璋起先对陈友定很敬重，诘问道：“元朝已亡，你为谁守城？”
陈友定虽遍身绳索，仍勃勃不屈，直斥道：“无须多言，除杀掉我以外，你又能干什么！”
老朱大怒，立命人杀陈友定及其儿子于闹市。
陈友定虽败亡，但对元朝忠心不贰，始终如一，父子骈首，慷慨赴死，不失为乱世大丈夫！
相较方国珍和福建的陈友定，朱元璋平定两广就顺利得多。洪武元年（1368年）三月，朱元璋命廖永忠、朱亮祖二人从海道取广东，又命湖广行省的杨璟带兵进取广西。结果，廖永忠水师甫到潮阳，就已经接到元朝广东行省左丞何真的降表。
何真东莞人，本为淡水盐场小管事。元末乱起，他结民自保城池，一步一步被元朝加官。此人很知“天命”，知道胳膊扭不过大腿，递降表后，亲自去惠州迎接廖永忠，就被马上安排入京见驾。
朱元璋大喜，赐宴，特赠白金千两，立授何真为江西行省参知政事，并誉为“识时达变”的天下豪杰。
何真降明，乱世自保而已，此人受元朝恩惠不多，投降又保全不少生民性命，无可厚非。
广西方面，明兵不是很顺利，围攻永州时死了不少军士。梧州方面还好，元朝当地的“达鲁花赤”，拜住（蒙古人好多叫这名字）率官吏父老迎降，藤州、容州相继而下。